一篇31分的高分文章带你了解单细胞分析方法如何做功能验证的研究思路！

由，通过 scRNA-seq数据分析，具体该癌细胞都为本还包括了粒状母细胞核瘤的基本细胞核情况下和细胞核一般来说。在来自 MGH157 的两个该组织切片的原位富大部分所，指明MES 都为粒状母细胞核瘤细胞核与上皮细胞核相邻（平面图1E）。为了更进一步具体这种相关联是否对MES 都为粒状母细胞核瘤细胞核不存在影响，所作将上皮细胞核能量消耗剂（氯膦酸盐）注射到肠道移植假设中所 ，捕捉到到氯膦酸盐管控后PDPN+PDGFRα-GFP+MES 都为粒状母细胞核瘤细胞核的百分比降低（平面图 1F），指明上皮细胞核的隐含影响MES 都为情况下的粒状母细胞核瘤细胞核的猎食。

上皮细胞核分泌的共价键招 MES 都为情况下

平面图 2

借助于已发表人脑粒状瘤单细胞核数据库集展开了共价键介导互作数据分析，发现上皮细胞核更离地隐含的五种共价键（AREG、GAS6、HBEGF、OSM 和 PDGFB）和它们的相应介导（AXL、EGFR、OSMR 和 PDGFRB）在粒状瘤恶性细胞核中所更离地隐含（平面图2A），但是与其他恶性情况下相比，上皮细胞核衍生的四种介导中所的三种（AXL、OSMR 和 PDGFRB）在人类所癌细胞中所优先由 MES 都为癌细胞核隐含，在scRNA-seq 和 TCGA 数据库大部分所都是这都为（平面图2B）。在肠道假设的可验证中所，五种共价键中所的只有两种（Osm 和 Hbegf）的过度隐含避免 MES 都为细胞核同位素减低有（平面图 2C）。因此，Osm 和 Hbegf 是上皮细胞核隐含的共价键，可在肠道假设中所招发体内粒状母细胞核瘤MES 都为情况下的可溶性。

在粘液人类所细胞核中所再现 OSM 招发 MES 都为情况下

平面图 3

在人类所细胞核中所是否能再现上皮细胞核招发粒状瘤母细胞核瘤向MES类情况下的发生变化呢？强强联合的所作们又降至此目的，在粘液又构筑了人粒状瘤母细胞核瘤假设，通过 scRNA-seq 数据分析了四个粒状母细胞核瘤粒状瘤假设（MGG23、MGG75、MGH143 和 MGG18），指明构筑的细胞核假设可以连续性在病症癌细胞中所捕捉到到的细胞核情况下（平面图3A，B）。与我们在肠道假设中所的捕捉到结果一致，用 OSM 管控后 CD44+ MES 都为细胞核减低有（平面图3C），OSM 管控避免 MES 都为细胞核比例减低有（平面图 3D）。

STAT3 通过 OSMR/LIFR-GP130 一个大物招发 MES 都为情况下

平面图 4

用 OSM 管控后， CD44 的招发在 OSMR KO 细胞核中所外降低，但在 OSMR 和 LIFR 的双重 KO 或 IL6ST 的 KO 中所完全扫除（平面图 4A 和 4B）。正因如此，LIFR 或 IL6ST KO 扫除了用 LIF 管控后 CD44 的招发，但 OSMR KO 没有扫除（平面图 4A 和 4B），这表明 LIF 对 MES 都为情况下的影响是由 LIFR/GP130 介导的异过氧化物一个大物。用来自人上皮细胞核或小粒状细胞核的前提条件基质，或 MGG23 与人上皮细胞核的粗略估计，捕捉到到十分相似的 CD44 招发（平面图 4C、4D）。指明OSM 在很大程度上足以再现上皮细胞核在MGG23 细胞核里招发 MES 都为情况下的发生变化。为了研究工作 OSM 招发 MES 都为情况下的潜在机制，所作探究了基因表达 8 种酪氨酸因子小依赖性 RNA 的影响，这些因子先同一时时有被发现用于调节粒状母细胞核瘤的时有充质情况下（CEBPB、STAT3、RELA、 TAZ、FOS、JUN、TEAD2 和 TEAD4)，通过用 OSM 或 BSA 管控后耗尽每种酪氨酸因子，然后使用Bulk RNA-seq对 MGG23 细胞核展开数据分析，捕捉到到STAT3 的能量消耗扫除了 OSM 招发的 MES 都为基因序列隐含，使得这些基因序列的隐含在 OSM 和 BSA 管控后相似（平面图 4E）。因此，OSM 介导的 MES 都为情况下的招发主要通过 STAT3 介导。

粒状母细胞核瘤相关联上皮细胞核的时有充质情况下

平面图 5

虽然上皮细胞核招发粒状母细胞核瘤细胞核的情况下发生变化，但它们也可能受到这种相互关键作用或粒状母细胞核瘤微环境中所其他元素的相互影响。为了聚焦这种可能性，所作比较了粒状母细胞核瘤上皮细胞核与其他粒状瘤的上皮细胞核的 scRNA-seq ，未检测到 MES 都为恶性细胞核的类别，还包括 IDH 突变型星形细胞核瘤、少突粒状细胞核瘤和 H3K27M 大脑粒状瘤。主化学物质数据分析的同一时时有两个主化学物质（PC1 和 PC2）醒目了粒状母细胞核瘤上皮细胞核与其他粒状瘤上皮细胞核两者之时有的差异（平面图 5A）。这表明粒状母细胞核瘤上皮细胞核指明了出与其他粒状瘤中所的上皮细胞核完全相同的服务器端，定义了一种新的上皮细胞核时有充质 (MP-MES) 情况下（平面图 5B）。但是，当比较细胞核上皮细胞核满分，捕捉到到与其他大脑粒状瘤相比，粒状母细胞核瘤中所 MP-MES 特征的隐含要更高得多（平面图 5C）。同样，所作从病症数据库集（平面图 5D）以粒状母细胞核瘤肠道假设（平面图 S5E）中所捕捉到到每个粒状母细胞核瘤内上皮细胞核的 MP-MES 满分不存在相当大的变异性。所作捕捉到到MP-MES 的这种变异性与 MES 都为粒状母细胞核瘤细胞核该系统性，无论是一环同一癌细胞的生活空时有区域（平面图 5E）还是一环完全相同癌细胞。

MES 都为情况下可能与 T 细胞核激活有关

平面图 6

所作的数据分析表明 TCGA-MES 癌细胞内的T细胞核可溶性（平面图 1A），T 细胞核可溶性可能与抗癌细胞活性的减低有或减缓有关，为了探究T细胞核情况下，所作更进一步健康检查了 T 细胞核依赖性基因序列与 MES 都为基因序列的该系统性性。与 T 细胞核基本上同位素该系统性性更高的基因序列（CD2、CD3D、CD3E 和 CD3G 少于）也与癌细胞的 MES 都为满分具有不够更高的该系统性性，解读了 T 细胞核同位素与 MES 两者之时有的基本上相关联 十分相似情况下（平面图 6A）。然而，主要该组织安全性一个大体 I 类（MHC-I）和 MHC-II 类的基因序列在 MES 都为粒状母细胞核瘤细胞核（以及 AC 都为细胞核）中所的隐含显著更低于 NPC 都为和 OPC 都为细胞核（平面图 6B）。为了测试粒状母细胞核瘤细胞核情况下对 T 细胞核介导的癌细胞装甲车辆的影响，所作创建了人类所 T 细胞核和 MGG75 细胞核系两者之时有的粗略估计该系统，借助于细胞核假设设计了隐含 NY-ESO-的 MGG75和隐含该组织安全性白细胞核依赖性的原代人类所 T 细胞核。粗略估计后MGG75 细胞核直接地激活了工程化的 T 细胞核，通过 T 细胞核活化（CD25 和 CD69）、脱粒（CD107a）和耗竭（PD-1）的markers（平面图 6C）所测量。为检测 MES 都为细胞核对T 细胞核反应差异性，所作在粗略估计同一时时有用 OSM 管控 MGG75 细胞核，并终于捕捉到到 T 细胞核活化和 T 细胞核介导的装甲车辆减低有（平面图 6C、6E、S6D）。表明T细胞核介导的粒状母细胞核瘤细胞核装甲车辆可能对 MES 都为情况下不够直接，并且通过 OSM 招发粒状母细胞核瘤细胞核向 MES 都为情况下发生变化可以促进这一过程。

总结

单细胞核数据分析是全文的数据分析手段，但是和它相对来说和其它单细胞核数据分析文献的模式截然完全相同，加有了科学实验假设的研究工作结果是不是逼格一更高，让你一开始没看懂呢，没事！不来多读几遍！功能科学实验的体内粘液假设构筑与可验证反复推进，让我们理解了粒状母细胞核瘤向时有充质都为（MES）情况下发生变化的癌细胞微环境关键作用机制，此文献的出色点：单细胞核天性定制数据分析（介导共价键互作）、公共数据库的可验证数据分析、细胞核假设或动物假设科学实验可验证，一定也要把这些运用在你的单细胞核研究工作课题中所。

译文链接：_omusS575xw

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